【人物專訪40】黑暗中長跑,解密未知的生物合成途徑—專訪中央研究院生物化學研究所林曉青副研究員

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【人物專訪40】黑暗中長跑,解密未知的生物合成途徑—專訪中央研究院生物化學研究所林曉青副研究員

採訪 /  何郁庭(科學推展中心執行編輯).撰稿 /  鄭懋奇 (科學推展中心特約編輯)

審訂 /  林曉青 副研究員 (中央研究院生物化學研究所)


 

一把能解開疾病枷鎖、藥物作用關鍵的鑰匙,可能藏在某株不起眼的植物或真菌裡——天然物化學為世界帶來了盼望,伴隨的卻是研究材料取得不易、產量稀微的瓶頸。有疑問,就去找出怎麼解決:擁有「努力型」研究人格的林曉青博士選擇直接探尋根本,尋覓天然物生物合成的途徑,過程如跑馬拉松般充滿了挫折與不易,而對知識的渴望,就是讓她持續跑下去的動機。

  

走上命定科學路,源於對「為什麼」的追尋

走上科學之路,對林曉青老師來說或許能稱得上是某種必然。老家在宜蘭,從小生活就被自然環繞,就連閱讀都獨愛科學專欄。童年經驗使她繼續朝這方向學習,大學考上藥學系,一路唸到大四,卻直到在醫院實習才意外發現,吸引她的是源頭的問題。

「為什麼?」就像童年的林曉青又跳了出來,那個對未知充滿好奇,對本源想追根究底的兒時精神,出現在她準備幫病患進行藥物諮詢的前置期,「我們需要搜尋資料,去了解藥物之間的作用。」林老師解釋道。她因此看見自己更渴望了解「為什麼藥物之間會有交互作用?」甚至是更根源性的問題:「最初這樣的知識是怎樣被發現?」這些冒出來的疑問如同小小火苗,點燃了她走向研究的渴望;了解知識——單純的四個字,就是這份渴望的本質。

 

研究方向華麗轉身:解決核心困境

和天然物活性的羈絆,始於她在臺大就讀藥學研究所的時期。當時指導教授是李水盛老師,實驗室研究主題為天然物的活性潛力。團隊主要以植物作為研究對象,希望透過測試生物活性結果,在植物中找到有藥物潛力的化合物。

說來簡單,卻不是待在實驗室內就能做好研究。植物長在山林裡,甚至可能在人煙罕至,必須徒步才能到達的位置。為了採集,開車到海拔兩千公尺的山上,再背著沈重的研究材料走個幾公里步道都是常態,若遇到天候不佳更是一番折騰。整個實驗室必須花費很大的功夫、很多時間,但即便真的找到具有生物活性化合物的植物,順利得出成果,核心問題仍舊沒有解決。

以植物作為天然物活性的材料,存在著難以取得、化合物產量少和產能有限等研究障礙,也讓後續的藥物活性測試與開發難以為繼。「為什麼?」在此時又成為解題的關鍵問句,植物為什麼能自己生成化合物?在自然界的生物體,是用什麼樣的方式生產出這些化合物?當疑問產生,答案就在不遠處,林曉青老師開始朝著「活性天然物生物合成」的方向找答案。

 

以微生物取代植物,異源性表達突破限制

這條路上的關鍵第二站,是她前往美國加州大學(UCLA)進行博士後研究的工作。在 UCLA Professor Yi Tang 的實驗室中,林曉青老師習得許多原本不熟悉的研究方式。像是引入分子生物學與生物資訊等新工具,且有別於以植物作為研究材料,改為針對微生物,尤其是真菌所生產的天然物,進行生物合成途徑的研究。

林曉青老師以「拼樂高」形容天然物的生合成,「可以想像這些最後做出來的有機化合物,或者化學分子,它就是一個最後組出來的樂高模型。」她又進一步說明,天然物合成過程有「酶」扮演催化反應的角色,就像我們組積木的動作,而積木是如何組成整個模型的?這就是他們致力於探究的「生物合成途徑」。

傳統從植物中取得藥用化合物的方法須等待植物生長,收成、萃取、純化,每一個步驟都曠日費時。因此若能以微生物取代植物,也就是運用異源性表達技術,就解決了生物化合物在實務應用上的一大核心問題。

 

找出天然物的合成路徑,編寫使用說明

除了化合物的材料來源,合成方式也是也是值得探究的重點。將天然物採化學合成的方式需要複雜步驟,也有較多先天限制,若能以「酶」直接作為催化劑,不僅效果更好,也可以達到「綠色化學」的理想,降低成本、減少環境污染。

然而這同時也是最困難的地方,從一個「假設」出發的搜尋,類似偵探辦案解題的過程,一開始只看到一個線索,如何抽絲剝繭,一步步找到真相?談到面對這股未知的感受,林曉青老師以電腦遊戲〈世紀帝國〉比喻,「一開始地圖是一片黑暗,你不清楚旁邊有什麼,也不知道我要發展什麼。」但透過多方蒐集資料與實驗確認,獲得的資訊會越來越完整,就像現在的確已經有一些藥物的製程是直接透過酶合成。

「過程」很重要。解析生物合成的途徑,要掌握的就是中間的每一步,哪個酶催化了哪個步驟的反應?哪一個步驟的反應可能限制了合成速度?回到拼樂高積木那個感覺裡,想知道這個模型怎麼被完成,要做的是翻開說明書;林曉青老師團隊在做的,就是寫出這本說明書。

 

做研究持努力信念長跑,投獎似實驗精神

 「我覺得我屬於努力型。」說起自己的研究人格,林曉青老師給了這樣一個答案。曾獲臺灣傑出女科學家獎、國科會傑出研究獎等殊榮,伴她走上頒獎臺的,是腳下許多次的失敗。她不諱言自己非一次申請就獲獎,但就算期待落空,她想的仍是:「我再試試看。」不把申請失利視為對個人成果的否定,因為獲獎與否,有時看得是機緣,或是積累的厚度。

她提起自己參加半程馬拉松的經驗,認為有去嘗試就是一個機會,而想要嘗試的心情,也會激勵自己投入時間去準備。所以申請獎項倒也有幾分與做實驗相似,「結果」是讓她知道有沒有需要調整的地方,調整後再看下一次的結果如何。漫長的研究生涯則更趨近於長程馬拉松,獲獎帶來的肯定如同路途中間的補給站,能夠補充水分、調整步伐,繼續前進。

 

把好奇當動機,困難同時是有趣

「不要害怕失敗,因為成功的結果,是由一段段清晰的過程累積而來。」呼應著自己的努力型研究人格,林曉青老師特別想跟後進分享這段話。此外,動機也很關鍵。「想想看,你的研究是為了要解決什麼問題,帶來什麼樣的改變。」她真誠地說。「問題」一直是驅動她走向研究的燃料,從「為什麼」開始,到「如何解決」,做研究就是一個找答案的過程。

對一件事的好奇心,促使她去搜尋資料,因而得以慢慢從未知走向了解、靠近答案的過程,林曉青老師非常享受。她也用這樣的態度和學生互動,不受限於理論,而是透過實驗方法和數據,得出最接近真理的結果。過程或許難免仍須經歷一望無際的黑暗,以及在黑暗中無所依怙的心情,但,林老師笑著回應:「這也正是科學研究中最有趣的地方。」

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